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La plus ancienne mention connue remonte en 968 ou l'on trouve marcilliaco villa sur le cartulaire d'Ainay.

Les différents noms retrouvés sont Marcilliacum, le domaine de Marcellus, puis au XIIIe siècle Marcilleu, en 1438 Marcilliaco d'Asergues, et enfin en 1573 Marcilly d'Azargues.

L'histoire de MARCILLY est marquée par 2 grandes seigneuries, avant 1718, les abbés d'Ainay et de 1718 à la révolution les Riverieulx de Varax.

L'origine de MARCILLY parait très ancienne, une nécropole remontant à l'époque burgonde et mérovingienne a été découverte récemment (1979).

La même année des sarcophages en pierre gallo-romaine de réemploi ont été exhumés.

Le développement de MARCILLY s'est faite dans le bourg au centre nord-ouest de la commune et 4 hameaux, la Bernadière, Bramefond, la Ferrandière, Montessuy.

La culture de la vigne était l'activité principale jusqu'au début des années 1900 ou la culture fruitière s'est développée.

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Population : 916 habitants

Nom des habitants : Marcillois, Marcilloises

Situation : au nord de Lyon et au sud de Villefranche sur Saône

Altitude : 312 m au point haut, 185 m au point bas

Superficie de la commune : 422 ha

Rivière : Azergues

Canton : Anse

Tourisme : Châteaux (Château de Janzé, Château de Varax, Manoir de Collonge), Randonnée

Communauté de Communes Beaujolais Pierres Dorées :
Depuis le 1er janvier 2014, la commune de Marcilly fait partie de cette nouvelle communauté de 34 communes : Alix, Ambérieux d'Azergues, Anse, Bagnols, Belmont d'Azergues, Le Bois d'Oingt, Le Breuil, Chamelet, Charnay, Chasselay, Châtillon d'Azergues, Chazay d'Azergues, Les Chères, Chessy les Mines, Civrieux d'Azergues, Frontenas, Lachassagne, Légny, Létra, Lozanne, Lucenay, Marcilly d'Azergues, Marcy sur Anse, Moiré, Morancé, Oingt, Pommiers, Pouilly le Monial, Saint Jean des Vignes, Saint Laurent d'Oingt, Sainte Paule, Saint Vérand, Ternand, Theizé.